Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rph3alQ768S4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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