Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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