Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NesQ6P5H2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms