Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzrn3Q69ZS0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Pdzrn3Q69ZS0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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