Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ss18Q62280 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ss18Q62280 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ss18Q62280 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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