Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prkd1Q62101 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms