Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctr9Q62018 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms