Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms