Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms