Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx25Q3ZT31 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx25Q3ZT31 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx25Q3ZT31 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx25Q3ZT31 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx25Q3ZT31 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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