Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms