Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms