Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Znf48Q3US17 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Znf48Q3US17 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms