Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms