Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmem253Q3UNB8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms