Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trafd1Q3UDK1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trafd1Q3UDK1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms