Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc174Q3U155 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms