Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TraddQ3U0V2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TraddQ3U0V2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms