Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2b3Q0VF55 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp2b3Q0VF55 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms