Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc1Q0VDN7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms