Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neurl1bQ0MW30 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neurl1bQ0MW30 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms