Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms