Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MestQ07646 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MestQ07646 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms