Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp2Q06649 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms