Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff2Q03404 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff2Q03404 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff2Q03404 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff2Q03404 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms