Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EgfrQ01279 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms