Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms