Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabpaQ00422 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms