Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmsP97355 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmsP97355 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmsP97355 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmsP97355 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmsP97355 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmsP97355 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmsP97355 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SmsP97355 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmsP97355 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SmsP97355 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmsP97355 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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