Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Otx1P80205 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Otx1P80205 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Otx1P80205 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms