Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rpl18aP62717 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms