Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rps29P62274 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms