Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CgnP59242 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CgnP59242 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CgnP59242 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CgnP59242 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CgnP59242 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CgnP59242 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CgnP59242 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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