Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csrnp1P59054 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms