Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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