Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcstnP57716 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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