Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms