Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxc13P50207 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc13P50207 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc13P50207 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc13P50207 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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