Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms