Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ItgavP43406 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ItgavP43406 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ItgavP43406 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms