Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtgfrP43117 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms