Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprmP28828 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PtprmP28828 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PtprmP28828 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PtprmP28828 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PtprmP28828 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PtprmP28828 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprmP28828 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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