Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms