Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtpraP18052 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms