Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Vpreb2P13373 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms