Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrygdP04342 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms