Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01792 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01792 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01792 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms