Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01787 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01787 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01787 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01787 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01787 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01787 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01787 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01787 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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