Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ifnb1P01575 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms