Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sap30O88574 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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